ESmol -- molecular viewer

ESmol - Molecular Viewer dla Androida

OGŁOSZENIE!

Jeśli urządzenie można uruchomić NDKmol, użyj go. Jest to o wiele szybciej i
mają więcej funkcji niż ESmol.
Można uzyskać NDKmol z https://play.google.com/store/apps/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol.

ESmol jest utrzymywany dla kompatybilności z bardzo starych urządzeń.

== O ==

ESmol to przeglądarka molekularna dla Androida.

Można zobaczyć, trójwymiarowe struktury białek, kwasów nukleinowych i małych cząsteczkach. ESmol obsługuje większość popularnych przedstawień dla cząsteczek, takich jak wstążka, ślad, kij, kuli i linii. ESmol obsługuje operacje symetrii; mogą być wyświetlane zespoły biologiczne i kryształ pakowania. Można wyszukiwać i pobierać konstrukcje RCSB WPB i NCBI pubchem.

ESmol ma prawie taką samą funkcjonalność jak GLmol, co jest napisane w
WebGL / JavaScript i działa w przeglądarkach internetowych. Można spróbować GLmol na http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Opis ==

* Przeczytaj plik PDB
   (ESmol nie można otworzyć dużych cząsteczek (więcej niż 3 MB). W tym celu należy użyć NDKmol na http://market.android.com/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol)
* Przeczytaj SDF plik / mol
* Wyszukiwanie i pobieranie konstrukcje RCSB WPB i NCBI pubchem
* Rotate / Translate / Powiększenie modelu przez palec
* Oświadczenia
    - Line
    - Kij
    - Kula (Promień van der Waalsa)
    - Alpha ślad węglowy
    - Ribbon
    - Strand
    - rura Czynnik B
    - drabina kwas nukleinowy
    - kwas nukleinowy linia
    - rozpuszczalnikowe „gwiazdy”
* Farbowanie
    - łańcuchem
    - Dzięki strukturze drugorzędowej (gdy określone w dokumentach arkuszu / śrubowej)
    - przez elementy
    - Stopniowanie (a.k.a chainbow)
    - współczynnik B
    - polarny / niepolarny
* Krystalografia
    - komórka elementarna Wyświetlacz
    - Pokaż kryształ pakowania (kiedy określono w sekcji uwaga)
    - Zespół wyświetlacza biologiczny (gdy określono w sekcji uwaga)

== Jak używać ==

Po uruchomieniu ESmol automatycznie ładuje deoxyhaemoglobin (PDBID: 4HHB) jako przykład. Można obracać cząsteczkę przez palca.
 
Aby powiększyć lub tłumaczyć cząsteczce, naciśnij przycisk MENU w telefonie / tablecie i wybierz tryb. gesty dwoma palcami są również obsługiwane.

Aby załadować inne pliki PDB, należy umieścić plik w katalogu „PDB” z karty SD i wybierz „Otwórz” polecenie w menu. Można również pobrać bezpośrednio ze struktur RCSB WPB a serwerem WWW NCBI pubchem. Wybierz „wyszukiwanie i pobieranie” w menu.

== Kontakt ==

Strona projektu znajduje się na http://webglmol.sourceforge.jp/. Można również uzyskać kody źródłowe.

Uwagi i sugestie są mile widziane w http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ lub [email protected]

=== === nocie licencyjnej

Sam ESmol jest na licencji GNU Lesser General Public License w następujący sposób.

Jednak pliki PDB włączone jako przykłady w różnych warunkach.
skonsultuj
http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

----

ESmol - Molecular Viewer dla Androida

     (C) Copyright 2011, biochem_fan

     Ten program jest wolnym oprogramowaniem: możesz go rozprowadzać dalej i / lub modyfikować
     to zgodnie z warunkami GNU Lesser General Public License opublikowanej przez
     Fundacja Wolnego Oprogramowania, według wersji 3 tej Licencji lub
     (Do wyboru) dowolnej późniejszej wersji.

     Ten program jest rozpowszechniany w nadziei, że będzie użyteczny,
     ale BEZ JAKIEJKOLWIEK GWARANCJI; nawet domyślnej gwarancji
     Handlowej lub przydatności do KONKRETNEGO CELU. Zobacz
     GNU Lesser General Public License więcej szczegółów.

     Powinieneś otrzymać kopię GNU Lesser General Public License
     wraz z tym programem. Jeśli nie, patrz .