ESmol -- molecular viewer

ESmol - Moleculaire Viewer voor Android

LET OP!

Als uw apparaat NDKmol kan draaien, dan kunt u gebruiken. Het is veel sneller en
hebben meer mogelijkheden dan ESmol.
U kunt NDKmol krijgen van https://play.google.com/store/apps/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol.

ESmol wordt gehandhaafd voor compatibiliteit met zeer oude apparaten.

== Over ==

ESmol is een moleculair viewer voor Android.

U kunt driedimensionale structuur van eiwitten, nucleïnezuren en kleine moleculen bekijken. ESmol geschikt voor de meeste voorkomende representaties voor moleculen, zoals lint, sporen, stok, bol en lijn. ESmol ondersteunt symmetrieoperaties; biologische assemblages en kristal verpakking kan worden weergegeven. U kunt zoeken en downloaden structuren van RCSB VOB en NCBI PubChem.

ESmol heeft bijna dezelfde functionaliteit als GLmol, dat is geschreven in
WebGL / Javascript en draait op webbrowsers. U kunt GLmol proberen http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Features ==

* Lees VOB-bestand
   (ESmol kan niet worden geopend grote moleculen (meer dan 3 MB). Hiervoor kunt u gebruik maken NDKmol bij http://market.android.com/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol)
* Lees SDF / MOL-bestand
* Zoeken en Download structuren van RCSB VOB en NCBI PubChem
* Rotate / Translate / Zoom model door vinger
* vertegenwoordigingen
    - Line
    - Stick
    - Sphere (van der Waals radius)
    - Alpha carbon trace
    - Lint
    - Strand
    - B factor tube
    - Nucleïnezuurladder
    - Nucleïnezuur lijn
    - solvent 'sterren'
* Coloring
    - Door keten
    - Door secundaire structuur (als gedefinieerd in BLAD / HELIX records)
    - Door Elements
    - Gradatie (a.k.a chainbow)
    - B-factor
    - polaire / niet-polaire
* Kristallografie
    - Display eenheidscel
    - Toon crystal verpakking (als gedefinieerd in REMARK sectie)
    - Display biologische samenstel (wanneer bepaald in REMARK sectie)

== Hoe te gebruiken ==

Bij de lancering, ESmol laadt automatisch deoxyhemoglobine (pdbid: 4HHB) als voorbeeld. U kunt het molecuul roteren door met uw vinger.
 
Te zoomen of te vertalen het molecuul, drukt u op MENU in uw telefoon / tablet en de modus te selecteren. Twee-vingerbewegingen worden ook ondersteund.

Om andere VOB-bestanden te laden, zorg er dan voor het bestand in "VOB" directory van de SD-kaart en selecteer "Open" commando in het menu. U kunt ook structuren rechtstreeks van RCSB VOB en de NCBI PubChem web server te downloaden. Selecteer "Search and Download" in het menu.

== Contact ==

Website van het project is gelegen op http://webglmol.sourceforge.jp/. U kunt ook broncodes.

Opmerkingen en suggesties zijn welkom op http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ of [email protected]

=== LICENTIE aankondiging ===

ESmol zelf is gelicenseerd onder GNU Lesser General Public License als volgt.

Echter, VOB-bestanden opgenomen als voorbeelden zijn onder verschillende omstandigheden.
Raadpleeg
http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

----

ESmol - Moleculaire Viewer voor Android

     (C) Copyright 2011, biochem_fan

     Dit programma is vrije software: je kunt het herdistribueren en / of aan te passen
     onder de voorwaarden van de GNU Lesser General Public License zoals gepubliceerd door
     de Free Software Foundation, onder versie 3 van de Licentie, of
     (Naar keuze) een latere versie.

     Dit programma wordt verspreid in de hoop dat het nuttig zal zijn,
     maar ZONDER ENIGE GARANTIE; zelfs zonder de impliciete garantie van
     Verkoopbaarheid of geschiktheid voor een bepaald doel. Bekijk de
     GNU Lesser General Public License voor meer details.

     U moet een kopie van de GNU Lesser General Public License hebben ontvangen
     samen met dit programma. Zo niet, zie .